40 research outputs found

    Molecular basis of histone tail recognition by human TIP5 PHD finger and bromodomain of the chromatin remodeling complex NoRC.

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    Tallant, C., et al., Structure 23, 80–92, January 6, 2015 http://dx.doi.org/10.1016/j.str.2014.10.017Binding of the chromatin remodeling complex NoRC to RNA complementary to the rDNA promoter mediates transcriptional repression. TIP5, the largest subunit of NoRC, is involved in recruitment to rDNA by interactions with promoter-bound TTF-I, pRNA, and acetylation of H4K16. TIP5 domains that recognize posttranslational modifications on histones are essential for recruitment of NoRC to chromatin, but how these reader modules recognize site-specific histone tails has remained elusive. Here, we report crystal structures of PHD zinc finger and bromodomains from human TIP5 and BAZ2B in free form and bound to H3 and/or H4 histones. PHD finger functions as an independent structural module in recognizing unmodified H3 histone tails, and the bromodomain prefers H3 and H4 acetylation marks followed by a key basic residue, KacXXR. Further low-resolution analyses of PHD-bromodomain modules provide molecular insights into their trans histone tail recognition, required for nucleosome recruitment and transcriptional repression of the NoRC complex.This work was supported by the UK Biotechnology and Biological Sciences Research Council (grants BB/G023123/1 David Phillips Fellowship to A.C. and BB/J001201/1 to A.C.) and a Federation of European Biochemical Societies short-term fellowship (04-11-12-10 to C.T.). We are grateful to Dr. Dimitri Y. Chirgadze of the Crystallographic X-Ray Facility at the Department of Biochemistry, University of Cambridge, and to the technical support at Diamond Light Source Synchrotron Facilities. We acknowledge support from the European Commission FP7 Programme under BioStruct-X (grant agreement 283570) for SAXS data collection at the EMBL (DESY). The SGC is a registered charity (No. 1097737) that receives funds from AbbVie, Bayer, Boehringer Ingelheim, the Canada Foundation for Innovation, the Canadian Institutes for Health Research, Genome Canada, GlaxoSmithKline, Janssen, Lilly Canada, the Novartis Research Foundation, the Ontario Ministry of Economic Development and Innovation, Pfizer, Takeda, and the Wellcome Trust (092809/Z/10/Z). E.V. is supported by a European Commission FP7 Marie Curie grant IDPbyNMR (contract 264257). P.F. is supported by a Welcome Trust Career Development Fellowship (095751/Z/11/Z)

    Evaluation of Legionella pneumophila Decrease in Hot Water Network of Four Hospital Buildings after Installation of Electron Time Flow Taps

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    Legionella spp. control is a critical issue in hospital with old water networks. Chemical disinfection methods are applied as a control measure over prolonged time periods, but Legionella may be resistant to chemical agents in pipeworks with low flow and frequent water stagnation. We evaluated Legionella spp. colonization in the hot water network of Italian hospitals after the installation of time flow taps (TFTs). In the period between 2017 and 2019, TFTs were installed in four hospital water networks. They were programmed in order to obtain a hot water flow of 192 L/day from each TFTs. A continuous chlorination system (chlorine dioxide) and a cold water pre-filtration device were applied in all the buildings. Before and after TFT installation, Legionella spp. was investigated at scheduled times. Before TFT installation, Legionella pneumophila was detected in all the hospitals with counts ranging from 2 × 102 to 1.4 × 105 CFU/L. After TFT installation, a loss in Legionella pneumophila culturability was always achieved in the period between 24 h and 15 days. Total chlorine concentration (Cl2) was detected in the range between 0.23 and 0.36 mg/L while temperature values were from 44.8 to 53.2 °C. TFTs together with chemical disinfection represent a method which improve water quality and disinfectant efficacy, reducing Legionella colonization in dead-end sections

    Drain Brain: monitorare il drenaggio cerebrale negli astronauti per prevenire problemi cardiovascolari

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    Un importante obbiettivo della ricerca spaziale internazionale, in preparazione all'esplorazione umana della Luna e di Marte, è quello di tutelare la salute degli astronauti. Il volo spaziale induce importanti alterazioni a carico di diversi sistemi fisiologici e queste risposte adattative inducono un generale decondizionamento dell'organismo. I programmi di ricerca medica hanno lo scopo di assicurare la salute degli astronauti che affronteranno viaggi spaziali oltre l'orbita bassa, permetterne la pronta operatività una volta arrivati a destinazione e consentirne un sicuro recupero al rientro sulla Terra. Fra i programmi messi in campo dall'Agenzia Spaziale Italiana (ASI), gli esperimenti denominati Drain Brain, svolti in collaborazione con l'Università di Ferrara, sono particolarmente esemplificativi da questo punto di vista. Il progetto, iniziato con la collaborazione di Samantha Cristoforetti nel 2014, ha permesso di dimostrare il funzionamento di un pletismografo per lo studio del circolo cerebrale ed il ritorno venoso dall'encefalo al cuore in condizioni di microgravità. Nei prossimi due anni, grazie al progetto Drain Brain 2.0, gli equipaggi della Stazione Spaziale Internazionale verranno studiati con una nuova versione del sensore pletismografico, sincronizzato con l'elettrocardiogramma, per valutare l'efficienza cardiaca ed il drenaggio cerebrale in rapporto a sintomi come vista offuscata, intorpidimento, annebbiamento o il temuto insorgere di una trombosi giugulare, legata al rallentamento del flusso per assenza del gradiente gravitazionale. Drain Brain 2.0 genererà anche importanti ritorni a Terra, chiudendo il circolo virtuoso dell'applicazione terrestre della ricerca condotta nello Spazio. La nuova strumentazione è di fatto ideale per un uso in telemedicina su pazienti cardiopatici o con problemi cognitivi

    Drain Brain: monitorare il drenaggio cerebrale negli astronauti per prevenire problemi cardiovascolari

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    Un importante obbiettivo della ricerca spaziale internazionale, in preparazione all'esplorazione umana della Luna e di Marte, è quello di tutelare la salute degli astronauti. Il volo spaziale induce importanti alterazioni a carico di diversi sistemi fisiologici e queste risposte adattative inducono un generale decondizionamento dell'organismo. I programmi di ricerca medica hanno lo scopo di assicurare la salute degli astronauti che affronteranno viaggi spaziali oltre l'orbita bassa, permetterne la pronta operatività una volta arrivati a destinazione e consentirne un sicuro recupero al rientro sulla Terra. Fra i programmi messi in campo dall'Agenzia Spaziale Italiana (ASI), gli esperimenti denominati Drain Brain, svolti in collaborazione con l'Università di Ferrara, sono particolarmente esemplificativi da questo punto di vista. Il progetto, iniziato con la collaborazione di Samantha Cristoforetti nel 2014, ha permesso di dimostrare il funzionamento di un pletismografo per lo studio del circolo cerebrale ed il ritorno venoso dall'encefalo al cuore in condizioni di microgravità. Nei prossimi due anni, grazie al progetto Drain Brain 2.0, gli equipaggi della Stazione Spaziale Internazionale verranno studiati con una nuova versione del sensore pletismografico, sincronizzato con l'elettrocardiogramma, per valutare l'efficienza cardiaca ed il drenaggio cerebrale in rapporto a sintomi come vista offuscata, intorpidimento, annebbiamento o il temuto insorgere di una trombosi giugulare, legata al rallentamento del flusso per assenza del gradiente gravitazionale. Drain Brain 2.0 genererà anche importanti ritorni a Terra, chiudendo il circolo virtuoso dell'applicazione terrestre della ricerca condotta nello Spazio. La nuova strumentazione è di fatto ideale per un uso in telemedicina su pazienti cardiopatici o con problemi cognitivi

    Free-standing graphene oxide and carbon nanotube hybrid papers with enhanced electrical and mechanic performance and their synergy in polymer laminates

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    Hybrid nanomaterials fabricated by the heterogeneous integration of 1D (carbon nanotubes) and 2D (graphene oxide) nanomaterials showed synergy in electrical and mechanical properties. Here, we reported the infiltration of carboxylic functionalized single-walled carbon nanotubes (C-SWNT) into free-standing graphene oxide (GO) paper for better electrical and mechanical properties than native GO. The stacking arrangement of GO sheets and its alteration in the presence of C-SWNT were comprehensively explored through scanning electron microscopy, X-ray photoelectron spectroscopy (XPS) and X-ray diffraction. The C-SWNTs bridges between different GO sheets produce a pathway for the flow of electrical charges and provide a tougher hybrid system. The nanoscopic surface potential map reveals a higher work function of the individual functionalised SWNTs than surrounded GO sheets showing efficient charge exchange. We observed the enhanced conductivity up to 50 times and capacitance up to 3.5 times of the hybrid structure than the GO-paper. The laminate of polystyrene composites provided higher elastic modulus and mechanical strength when hybrid paper is used, thus paving the way for the exploitation of hybrid filler formulation in designing polymer composites
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